021-31246627

以细胞衰老和T细胞活化为研究体系，结合高通量测序、分子生物学和生物信息学等手段研究复杂而多样化的转录组调控，特别是选择性转录起始、反义转录本、内含子保留和选择性多聚腺苷酸化这几种重要RNA水平调控方式的生物学功能和分子机制。以第一作者或通讯作者在Nature Methods, Nature Protocols, BMC Genomics等杂志发表研究论文。申请13项中美专利，5项已获授权。长远目标：通过研究真核生物转录组的多样性，了解高等生物复杂的基因调控网络，并为深入理解人类疾病的表达机制提供理论依据。

男，1977年出生，博士，研究员，博士生导师。2000年获北京大学生命科学学院生物化学及分子生物学系学士学位，2000-2006年硕博连读于北京大学生命科学学院并于2007年获植物学博士学位。2007-2010年在美国杜克大学基因组科学与政策研究所从事博士后研究。2010-2012年在美国国立卫生研究院(NIH)担任助理研究员(Research Fellow)。2012年受聘为复旦大学生命科学学院研究员。

以细胞衰老和T细胞活化为研究体系，结合高通量测序、分子生物学和生物信息学等手段研究复杂而多样化的转录组调控，特别是选择性转录起始、反义转录本、内含子保留和选择性多聚腺苷酸化这几种重要RNA水平调控方式的生物学功能和分子机制。以第一作者或通讯作者在Nature Methods, Nature Protocols, BMC Genomics等杂志发表研究论文。申请13项中美专利，5项已获授权。长远目标：通过研究真核生物转录组的多样性，了解高等生物复杂的基因调控网络，并为深入理解人类疾病的表达机制提供理论依据。

1. Ni T#, Corcoran DL#, Rach EA, Song S, Spana EP, Gao Y, Ohler U* and Zhu J*. A paired-end sequencing strategy to map the complex landscape of transcription initiation. Nature Methods (Article), 2010; 7: 521-527

2. Ni T#*, Yang W#, Han M#, Zhang Y, Shen T, Nie H, Zhou Z, Dai Y, Yang Y, Liu P, Cui K, Zeng Z, Tian Y, Zhou B, Wei G, Zhao K, Peng W*, Zhu J*. Global intron retention mediated gene regulation during CD4+ T cell activation. Nucleic Acids Research. 2016; 44(14):6817-29

3. Ni T#*, Yang Y#, Hafez D, Yang W, Kiesewetter K, Wakabayashi Y, Ohler U, Peng W and Zhu J*. Distinct polyadenylation landscapes of diverse human tissues revealed by a modified PA-seq strategy. BMC Genomics, 2013; 14(1):615

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5. Shen T, Li H, Song Y, Yao J, Han M, Yu M, Wei G*, Ni T*. Antisense transcription regulates the expression of sense gene via alternative polyadenylation. Protein Cell, 2017; DOI: 10.1007/s13238-017-0497-0