现代人类学国际科技合作基地于2012年经科技部认定成立，是我国唯一以人类学跨领域研究为核心的国际科技合作基地。基地以人群多样性为研究切入点，围绕“人类多样性的形成与演化机制”这一关键科学问题，与德国、瑞典、马来西亚等多个国家开展深度科研合作，聚焦人类基因组、表型组及其互作机制与应用研究，系统解析人群及个体间在体质、生理、病理等层面的表型差异及其形成规律，提出依托人类遗传多样性与进化特征的精准健康新方案，为健康中国战略实施、人类命运共同体构建提供坚实科技支撑，也为铸牢中华民族共同体意识、推动全球文明交流互鉴贡献理论方法与科学见解。

基地紧密对接国家重大战略需求，在人群多样性形成与演化规律、人类体质—生理—病理差异的生物学基础、人群源流与语言演化、遗传资源保护与利用、人类学应用研究等领域开展全方位国际合作。通过共建多个联合研究平台与协作网络、牵头承担多项国家级国际合作项目，基地在精准医学、人类表型组学等方向取得标志性成果，尤其在组学大数据质量控制与标准化体系构建、东亚人群遗传结构时空演化、泰州队列建设及精准医学应用、典型自身免疫病致病机制与诊疗策略等方面实现系列重要突破。

依托复旦大学多学科深度交叉融合、基础研究与应用转化紧密衔接的优势，基地已逐步建设成为人类学原创理论创新策源地、高层次创新人才培养高地与具有重要国际影响力的学术交流中心。